Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBL2Q562R1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms