Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms