Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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