Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM187BQ17R55 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM187BQ17R55 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms