Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
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