Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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ECM1Q16610 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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