Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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