Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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CNGA3Q16281 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CNGA3Q16281 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CNGA3Q16281 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CNGA3Q16281 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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