Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms