Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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