Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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