Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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