Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM28Q13263 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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