Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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