Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RESTQ13127 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RESTQ13127 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RESTQ13127 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RESTQ13127 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RESTQ13127 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RESTQ13127 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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