Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms