Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZIM2-203ENST00000595671 2054 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.513e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ZIM2-205ENST00000597281 2037 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -13e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-239ENST00000617548 1063 ntTSL 1 (best)22.95■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-238ENST00000616352 1626 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-236ENST00000615229 1468 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 11e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-235ENST00000614789 662 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-246ENST00000621960 551 ntTSL 59.52□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 FAM95C-204ENST00000637322 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.55■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 FAM95C-203ENST00000637288 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.04□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 FAM95C-202ENST00000636756 654 ntTSL 26.57□□□□□ -1.363e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC45-204ENST00000428937 577 ntTSL 518.24■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.011e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.211e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.261e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.271e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-218ENST00000496723 661 ntTSL 53.75□□□□□ -1.811e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CD46-219ENST00000636114 2098 ntTSL 52.4□□□□□ -2.031e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.475e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.592e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-8■■■□□ 16.6
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ILF3Q12906 CMPK1-202ENST00000371871 1212 ntTSL 222.61■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PROC-208ENST00000442644 600 ntTSL 319.67■□□□□ 0.742e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 16.6
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ILF3Q12906 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-9■■■□□ 16.6
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ILF3Q12906 PRMT7-205ENST00000562050 1005 ntTSL 316.97■□□□□ 0.315e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.147e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-206ENST00000562381 713 ntTSL 215.84■□□□□ 0.135e-6■■■□□ 16.6
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ILF3Q12906 PIKFYVE-206ENST00000443896 3282 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.027e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.017e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-212ENST00000564050 846 ntTSL 514.84□□□□□ -0.035e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.125e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.255e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.255e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-209ENST00000563520 839 ntTSL 312.81□□□□□ -0.365e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-213ENST00000564441 1011 ntTSL 312.57□□□□□ -0.45e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-226ENST00000569047 648 ntTSL 512.04□□□□□ -0.485e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-223ENST00000567542 3542 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.495e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 411.94□□□□□ -0.57e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.517e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 411.49□□□□□ -0.577e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-201ENST00000250379 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-203ENST00000396249 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-209ENST00000527381 592 ntTSL 510.99□□□□□ -0.651e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-206ENST00000640220 2068 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.687e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-225ENST00000568975 2996 ntTSL 210.68□□□□□ -0.75e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-218ENST00000566341 562 ntTSL 410.42□□□□□ -0.745e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-207ENST00000525153 1476 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.781e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 UQCRC2-201ENST00000268379 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-13■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-204ENST00000412033 825 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.911e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.937e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.947e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.947e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-208ENST00000563443 540 ntTSL 38.99□□□□□ -0.975e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-210ENST00000563562 487 ntTSL 58.62□□□□□ -1.035e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-13■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.177e-9■■■□□ 16.6
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