Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms