Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms