Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD83Q01151 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD83Q01151 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms