Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRX1P78414 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRX1P78414 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRX1P78414 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms