Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms