Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPL2P60520 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL2P60520 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms