Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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