Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms