Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP1P56182 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRP1P56182 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms