Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX9P55771 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX9P55771 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms