Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCL1P53675 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCL1P53675 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCL1P53675 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms