Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms