Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms