Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms