Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms