Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms