Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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