Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMO1P25800 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms