Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms