Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms