Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL1P22362 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL1P22362 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL1P22362 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms