Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2P22307 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2P22307 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCP2P22307 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCP2P22307 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCP2P22307 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms