Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD247P20963 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD247P20963 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD247P20963 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms