Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms