Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms