Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms