Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms