Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms