Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG12O94817 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms