Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms