Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms