Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms