Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms